卵巢囊肿做手术可能会引起上腹部疼痛、卵巢功能受损、人工流产综合征、出血等危害，建议患者做卵巢囊肿手术选择正规的医院，术后做好护理工作，减少危害的发生。

1、上腹部疼痛：卵巢囊肿是妇科比较常见的疾病，如果是较大的卵巢囊肿，需要进行手术切除治疗。在手术过程中会对腹部组织造成一定的损伤，可能会导致上腹部出现疼痛，这种情况一般通过休息能够得到较好的缓解;

2、卵巢功能受损：如果进行卵巢囊肿手术时，没有将囊肿切除干净，可能会导致部分卵巢组织残留在腹腔内，影响正常的卵巢功能，导致卵巢功能减退，出现月经失调、闭经等异常情况，甚至可能会导致不孕;

3、人工流产综合征：如果是进行卵巢囊肿切除手术时需要进行刮宫，在刮宫的过程中可能会过度牵拉宫颈，导致子宫出现异常收缩，从而容易引起人工流产综合征，如恶心、呕吐、面色苍白、血压下降等，严重时可能会导致休克;

4、出血：如果在进行卵巢囊肿手术时损伤血管，当时可能并不会出血，但是后期随着血压升高、凝血机制发生改变，则可能会导致手术部位出现出血的情况。

此外，如果卵巢囊肿较大，剥除时可能会导致卵巢功能不全，引起后期月经异常，如月经稀少等。如果患者出现卵巢囊肿，应及时到妇科就诊，完善B超等检查，明确后遵医嘱进行针对性治疗，以免延误病情，对身体造成不必要的损伤。在治疗期间，患者需要保持良好的生活作息，避免熬夜，以免影响病情的恢复。