精子畸形率高、唇腭裂，可能是不良生活习惯导致的，也有可能是染色体异常、生殖系统感染等原因引起的。建议患者及时去医院就诊，在医生指导下进行针对性治疗。

一、原因

1.不良生活习惯：如果长期吸烟喝酒或者经常熬夜，可能会对精子的质量造成影响，从而出现精子畸形的情况，并且还会伴有嘴唇和上颚发育不全的现象。

2.染色体异常：如果夫妻双方有一方存在染色体异常的情况，则会导致胎儿在生长发育过程中出现先天性缺陷，甚至会出现唇腭裂等情况。

3.生殖系统感染：如果男性平时没有做好局部卫生工作，受到细菌等致病菌的入侵后，容易诱发前列腺炎、附睾炎等疾病，会对精子的质量造成一定的影响，也会引起上述症状。

二、治疗

如果是不良生活习惯造成的，可以通过调整生活方式的方式进行改善，比如戒烟戒酒、早睡早起等。如果是染色体异常引起的，可以在怀孕前通过三代试管婴儿技术来提高胚胎质量。如果是生殖系统感染引起的，可以遵医嘱服用阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒等药物进行抗感染治疗。

除此之外，还可能与遗传因素有关，需要根据病因采取合适的治疗措施。