发低烧小便刺痛，可能是泌尿系统感染、生殖系统感染、病毒感染等原因导致，建议完善尿常规、血常规、CT等相关检查，明确诊断后，针对病因进行药物治疗或手术治疗。

1、泌尿系统感染：如膀胱炎、肾盂肾炎等，炎症刺激可以导致膀胱功能出现异常，出现发低烧小便刺痛的情况。这种情况可以选择抗生素进行治疗，临床上常用的有左氧氟沙星片、盐酸环丙沙星片等，同时可以配合物理治疗，如温水坐浴，使用热毛巾擦拭额头、腹股沟等部位;

2、生殖系统感染：如女性的阴道炎、男性的前列腺炎等，当生殖系统受到病原体感染时，可能会导致发低烧小便刺痛。如果是由细菌感染导致的炎症，可以选择抗生素进行治疗，如注射用头孢曲松钠、注射用头孢他啶等。如果是由霉菌感染导致的炎症，可以选择抗真菌的药物，如氟康唑胶囊等;

3、病毒感染：病毒感染也可能导致发低烧小便刺痛，如带状疱疹病毒感染，此时需要进行抗病毒治疗，可以应用阿昔洛韦片、泛昔洛韦片等药物;

4、其他原因：如外阴溃疡，女性外阴溃疡可能会导致发低烧小便刺痛，同时伴有外阴红肿、外阴破溃等表现，通常需要对症治疗，如应用红霉素软膏局部涂抹，缓解症状。

发低烧小便刺痛时要注意多喝水，勤排尿，有利于病情的恢复。在治疗期间应注意清淡饮食，避免食用辛辣、刺激性食物。