肛门囊肿通过指检一般是可以被发现的。

肛门囊肿可以通过指检被发现，因为囊肿通常表现为肛门周围可触及的肿块或硬结，触之有波动感。而指检是常规的肛门检查方法，医生可以用手指轻柔地按压肛门区域以评估是否有异常。如果怀疑有囊肿或其他疾病存在，建议及时就医进行进一步的影像学检查以明确诊断。

若患者患有痔疮、肛裂等疾病时，在进行指检的过程中可能会误认为是囊肿，从而引起混淆。

在进行肛门指检前应避免摄入刺激性食物和饮料，以免影响指检结果的准确性。同时，保持肛门部位清洁干燥也是至关重要的。