手足口病引发的脑炎诊断需排除时，可考虑采取脑脊液检查、头颅MRI、抗病毒治疗、镇静剂应用、降温治疗等措施进行治疗。

1.脑脊液检查

脑脊液检查通过抽取患者腰椎穿刺样本来评估其感染状态，有助于诊断是否伴有脑炎。对于疑似存在中枢神经系统受累者，如头痛、呕吐等症状明显时，应立即进行以确定病情严重程度。

2.头颅MRI

头颅MRI利用强磁场和无线电波成像大脑结构，可显示软组织对比度高，能够发现微小病变。

对于有典型症状但临床表现不典型的病例中使用，以辅助判断是否存在神经元损伤。

3.抗病毒治疗

抗病毒治疗旨在针对特定病毒，如EV71等，选择合适的抗病毒药物进行干预，减少病毒对机体的损害。对于确诊为手足口病且存在神经系统并发症风险的患者，及时使用抗病毒药物是必要的。

4.镇静剂应用

镇静剂可以减轻躁动不安及疼痛，缓解压力，促进休息，有利于脑部恢复。当患者处于高度紧张或焦虑状态时，医生会根据需要开具镇静剂处方。

5.降温治疗

降温治疗能降低体温，防止进一步脑损伤，并帮助身体对抗由高热引起的代谢紊乱。对于存在发热的患者，在临床上通常采用物理降温与药物降温相结合的方式。

在排除手足口病引发的脑炎过程中，应密切监测患者的临床表现，尤其是意识水平的变化。同时，保持适当的营养支持和充足的休息，有助于提高机体抵抗力，促进康复。