三个月没来月经也没怀孕可能是下丘脑功能紊乱、垂体功能减退、多囊卵巢综合征、甲状腺功能减退、肾上腺皮质功能不全等疾病因素导致的，需根据具体病因进行针对性治疗。建议患者及时就医，以便进行相关检查和确诊。

1.下丘脑功能紊乱

下丘脑是调节生殖激素的重要中枢，其功能紊乱可能导致内分泌失调，进而影响月经周期。针对下丘脑功能紊乱的治疗可能包括使用促性腺激素释放激素类似物等药物进行替代疗法。

2.垂体功能减退

垂体分泌多种激素，包括黄体生成素和卵泡刺激素，这些激素对月经周期至关重要。垂体功能减退会导致这些激素水平下降，从而导致停经。补充缺失的垂体激素是治疗垂体功能减退的主要方法，例如口服甲泼尼龙、地塞米松等糖皮质激素类药物。

3.多囊卵巢综合征

多囊卵巢综合征是一种复杂的生殖内分泌代谢异常疾病，以雄激素升高、持续无排卵、卵巢多囊样改变等为特征，表现为多毛、痤疮、月经不规律、不孕等。雄激素促使卵泡膜细胞产生较多的抑制素A，通过负反馈作用，使FSH水平下降，卵泡发育受阻，不能形成优势卵泡，故无排卵。患者可以在医生指导下服用炔雌醇环丙孕酮片、醋酸氯地孕酮等药物改善高雄激素血症并调整月经周期。

4.甲状腺功能减退

甲状腺功能减退时，甲状腺激素合成不足，反馈性地引起下丘脑TRH和垂体TSH的分泌增加，但甲状腺组织由于自身免疫损伤后，甲状腺激素合成能力降低，此时机体处于高TRH、高TSH的状态，可出现闭经的现象。患者可在医生指导下使用左甲状腺素钠片、甲状腺片等药物纠正低甲状腺素状态，改善症状。

5.肾上腺皮质功能不全

肾上腺皮质激素具有促进蛋白合成、抑制脂肪分解的作用，当肾上腺皮质功能减退时，肾上腺皮质激素分泌减少，蛋白质合成障碍，脂肪分解增多，导致体重减轻、食欲减退等症状，进而影响月经周期。肾上腺皮质功能不全的患者需要及时就医，在专业医师指导下使用氢化可的松注射液、注射用甲泼尼龙琥珀酸钠等药物缓解不适症状。

建议关注月经周期的变化，必要时进行妇科超声检查以及内分泌相关检查如空腹血糖测定、血脂分析等，以排除其他潜在的健康问题。