确诊先天性巨结肠的主要检查方法包括直肠指诊、钡剂灌肠造影、肛门直肠测压、电刺激肛门直肠反射测压以及活检。如果症状或体征指向可能的巨结肠，建议寻求儿科消化科医生进行进一步评估和确诊。

1.直肠指诊

通过医生的手指触摸婴儿的肛门及周围区域来评估其内部情况。

在无痛或轻度不适下进行快速、简便的操作，在安静状态下完成以减少婴儿的不适感。

2.钡剂灌肠造影

钡剂灌肠造影是一种影像学检查，可以显示结肠的形态和功能，帮助诊断先天性巨结肠。患者需要服用一种特殊的白色糊状物作为对比剂，然后平躺在床上等待一段时间以便观察结果。

3.肛门直肠测压

肛门直肠测压是通过测量肛门括约肌和直肠壁的压力变化来评估肠道运动功能的一种方法，可辅助诊断先天性巨结肠。将一根带有传感器的小管子插入肛门中记录压力数据，通常需要多次重复以获得准确结果。

4.电刺激肛门直肠反射测压

电刺激肛门直肠反射测压是利用电流刺激肛门周围的神经，观察是否能引起正常反射活动，有助于先天性巨结肠的诊断。在医院由专业人员操作，在局部麻醉下将电极贴片放置于指定位置并给予特定强度的电刺激。

5.活检

活检是指从体内取出一小块组织样本进行病理学分析，以确定是否存在异常增生或炎症等病变。在局部麻醉下从小肠或结肠处取样，送至实验室进行显微镜下观察。

以上各项检查均需在有经验的医师指导下进行，并可能需要提前预约。建议避免进食含纤维素丰富的食物如芹菜、韭菜等，以免影响检查结果。