三个月的宝宝吐奶可能是由幽门螺杆菌感染、先天性食管闭锁、胃食管反流病、先天性肥厚性幽门狭窄、先天性巨球蛋白血症等病因引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。
1.幽门螺杆菌感染
幽门螺杆菌感染会导致胃黏膜炎症和水肿，影响食物消化吸收，进而引起吐奶。可使用抗生素如阿莫西林、克拉霉素等进行根除治疗。
2.先天性食管闭锁
先天性食管闭锁导致吞咽困难，无法将吃进去的食物顺利送入胃中，从而出现吐奶现象。手术是治疗先天性食管闭锁的主要方法，例如食管端端吻合术。
3.胃食管反流病
胃食管反流病时，由于胃酸和胃内容物逆流入食管，会引起吐奶以及烧心、嗳气等症状。患者可在医生指导下服用抑酸药物进行治疗，比如奥美拉唑、雷贝拉唑钠等。
4.先天性肥厚性幽门狭窄
先天性肥厚性幽门狭窄是因为幽门肌层增生肥厚而引起的机械性梗阻，使胃排空障碍，继而导致呕吐的发生。经皮胃造瘘术是一种有效的治疗方法，通过小切口在皮肤上建立人工通道进入胃内进行喂养。
5.先天性巨球蛋白血症
先天性巨球蛋白血症是指B淋巴细胞异常增殖，产生大量无功能IgM抗体，导致血液粘稠度增高，引起胃肠道血液循环受阻，进而引发吐奶的现象。主要通过化疗方式进行治疗，常用药物有环磷酰胺、苯丁酸氮芥等。
建议密切观察宝宝的吐奶频率和量，若频繁吐奶且伴有体重下降，应尽快就医。必要时，可以进行胃镜检查、X线钡餐造影或超声波检查以评估胃部状况。
