肺囊肿的严重性因个体差异而异，从轻微至危及生命不等。
肺囊肿的严重程度取决于其大小、位置、数目以及是否有并发症。对于无症状的小囊肿，由于不会对周围组织造成压迫，也不会影响正常的通气功能，所以病情较轻，预后较好；而对于较大的囊肿，则会因为压迫周围的肺组织和支气管，导致患者出现咳嗽、咳痰、喘息、呼吸困难等症状，甚至会引起继发感染，此时病情比较严重，如果不及时治疗，可能会导致呼吸衰竭，甚至威胁到患者的生命安全。
如果肺囊肿发生破裂或引起严重的并发症，如感染或出血，也会增加风险。
面对肺囊肿，应定期监测以早期发现异常变化，并在必要时遵医嘱使用抗生素来预防感染。
