肛门指检后小腹疼腹泻可能是由于局部炎症或感染引起的。

肛门指检是一种常见的检查方法，通常不会导致小腹疼痛和腹泻。如果在指检过程中发现有痔核、息肉、肿瘤等情况，可能会对直肠壁造成一定的刺激和损伤，引起局部炎症反应，从而导致小腹疼痛和腹泻等症状。建议患者及时就医进行进一步的诊断和治疗。

若患者还伴有发热、恶心呕吐等现象，则可能与肠道菌群失调症有关。肠道菌群失调可能导致消化功能减弱，进而引发上述不适症状。可遵医嘱使用双歧杆菌三联活菌胶囊、枯草杆菌二联活菌颗粒等益生菌制剂来改善症状。

在接受肛门指检时应避免紧张，配合医生操作以减少不适感，并注意观察自身是否出现异常反应。如有疑问或不适，应及时向医生咨询。