HPV感染通常不会直接导致腰疼、头疼，但在个别情况下，如病毒扩散到中枢神经系统，可能会诱发相关症状。

大多数情况下，HPV感染主要通过皮肤与黏膜接触传播，一般不会对中枢神经系统造成直接影响，因此不会直接导致腰疼、头疼。若患者免疫系统受到抑制或者存在免疫缺陷，此时机体无法有效抵御HPV感染，可能导致病毒向中枢神经系统扩散，从而诱发上述不适症状。

如果患者的免疫力低下或处于免疫应激状态，可能会影响身体的抵抗力，使病情加重，进而出现头痛、腰痛等症状。

虽然HPV感染通常不会直接引起腰疼、头疼，但如果患者有持续的疼痛或其他异常症状，应及时就医以排除其他潜在疾病的可能性。