孕妇肠胃不舒服可以考虑使用马来酸曲美布汀、多潘立酮、乳酶生、双歧杆菌制剂或胰酶制剂等药物进行治疗。但是，由于孕期特殊的生理状况，建议在咨询医生后再服用这些药物。
1.马来酸曲美布汀
马来酸曲美布汀可用于治疗胃肠功能紊乱引起的恶心、呕吐、食欲不振等症状。该药物能促进胃肠运动和改善消化吸收功能。 肠梗阻患者禁用本品。
2.多潘立酮
多潘立酮适用于缓解由胃排空延迟引起的不适症状。此药物能够增强食道下端括约肌张力，抑制膈肌的反流从而改善症状。 闭角型青光眼、前列腺肥大患者慎用。
3.乳酶生
乳酶生可应用于因肠道菌群失调而引起的各种消化不良症。其作为活肠球菌的代谢产物，在肠道内分解糖类产生乳酸，提高肠内渗透压，抑制致病菌，保护了有益菌，并刺激肠道蠕动，调整肠黏膜电解质及分泌液的pH值，以维持正常生理机能。 对本品过敏者禁用。
4.双歧杆菌制剂
双歧杆菌制剂有助于恢复并保持肠道微生态平衡，改善腹胀、腹泻等不适症状。通过选择性地作用于人体肠道，抑制肠道中腐败细菌的生长繁殖，调节肠道菌群平衡。 孕妇应在医师指导下服用。
5.胰酶制剂
胰酶制剂适合用于治疗消化不良、慢性胆囊炎等病症所引发的不适症状。本品含有的脂肪酶、淀粉酶以及蛋白酶等物质，能够帮助改善食物的消化吸收情况。 慢性胰腺炎急性发作期不宜使用。
孕期出现肠胃不适时，应避免盲目用药，以免影响胎儿健康发育。建议采取饮食调理的方式进行缓解，如小米粥、鸡蛋羹等易消化的食物，减轻对胃肠道的负担。同时，注意休息，保证充足的睡眠时间，有利于身体恢复。
