男性尿道流脓并小便刺痛可能是尿道炎、淋病奈瑟菌性尿道炎、非淋菌性尿道炎等原因引起的，需要针对具体病因进行针对性处理。
尿道炎是由淋球菌或非淋球菌感染引起的尿道黏膜炎症，由于炎症刺激，可导致尿道口红肿、瘙痒、疼痛以及分泌物增多，进而表现为尿道流脓及排尿时疼痛的症状。淋病奈瑟菌性尿道炎主要是由淋病双球菌感染所致，会导致尿道口灼热感、瘙痒、红肿，并有稀薄黏液流出，随着病情进展，会出现黄色或者黄绿色脓性分泌物，还可伴有尿频、尿急、尿痛等症状。非淋菌性尿道炎主要通过不洁性行为传播，由沙眼衣原体、解脲支原体等致病菌感染引起，典型症状为尿道刺痒、烧灼感，同时还会伴随尿道口红肿、尿道口少量浆液性或稀薄黏液分泌物流出等情况，严重者可出现尿道流脓现象。
此外，还应考虑前列腺炎、附睾炎等疾病的可能性。这些疾病也可能导致尿道流脓和小便刺痛的现象发生。但通常与特定的临床表现和实验室检查结果相一致。
在诊断明确前，患者不宜自行使用抗生素治疗，以免影响后续的药物敏感试验结果，也不利于医生判断是否耐药。建议患者及时就医，在专业医师指导下接受规范化诊疗。
