男性小便时发热、刺痛和流脓可能是尿路感染所致，需要到医院就诊以获得适当的治疗。

尿路感染是由细菌或其他病原体引起的泌尿系统感染，包括尿道、膀胱、输尿管和肾脏。当感染发生时，免疫系统会释放白细胞和其他炎症因子来对抗病原体，这会导致局部组织发红、肿胀和疼痛，进而引起上述不适症状。若不及时治疗，感染可能会向上蔓延至肾脏，引起肾盂肾炎等并发症，因此建议患者及时就医诊治。

如果患者还伴有尿频、尿急等症状，则可能为急性淋病奈瑟菌性尿道炎或非淋菌性尿道炎。这些疾病通常由特定的病原体感染引起，需要通过药物敏感试验结果选用合适的抗生素治疗。

针对男性小便时出现发热、刺痛和流脓的症状，应避免过度使用消毒剂以防破坏尿道微生态环境，同时保持良好的个人卫生习惯，多饮水促进排尿也有助于缓解症状。