感染HPV的女性通常可以喝双歧杆菌三联活菌胶囊、复方嗜酸乳杆菌片、枯草杆菌二联活菌颗粒等益生菌进行治疗，并不会对HPV感染造成特殊影响，同时也可以调节肠道菌群，辅助改善阴道炎症。
1、双歧杆菌三联活菌胶囊：属于一种复方制剂，主要成分包括嗜酸乳杆菌、保加利亚乳杆菌以及少量蜡样芽孢杆菌，而且还含有少量葡萄糖酸锌、维生素B、维生素D等多种成分，可以起到调节肠道菌群的作用，通常用于治疗肠道菌群失调引起的腹泻、腹胀、慢性腹泻等症状。如果女性在感染HPV期间出现了上述疾病，可以在医生指导下喝双歧杆菌三联活菌胶囊进行治疗;
2、复方嗜酸乳杆菌片：属于一种助消化类的药物，可以起到调节肠道菌群的作用。HPV感染的女性在患病期间可能会引起肠道菌群紊乱，导致出现腹胀、腹痛、嗳气等症状，复方嗜酸乳杆菌片能够帮助调节肠道内的菌群，缓解以上症状;
3、枯草杆菌二联活菌颗粒：属于一种益生菌，通常用于治疗由于肠道菌群失调引起的腹泻、腹胀、消化不良等症状，也可用于治疗HPV感染导致的肠道功能紊乱。女性在HPV感染期间，也可能会引起食欲不振的现象，枯草杆菌二联活菌颗粒能够调节胃肠道菌群，辅助改善以上不适症状;
4、其他益生菌：如地衣芽孢杆菌活菌颗粒、酪酸梭菌活菌散等，上述益生菌通常也可用于调节阴道炎症，改善阴道内环境，辅助改善HPV感染女性出现的阴道瘙痒、阴道分泌物增多等症状。
除上述药物外，感染HPV的女性还可以遵医嘱使用抗病毒药物进行治疗，如阿昔洛韦片等，可能会使药物疗效达到较好的效果，从而起到治疗的作用。此外，在治疗期间也需要注意局部卫生清洁，勤换洗内裤，尽量避免性生活。
