儿童疱疹性咽峡炎的发热持续时间通常为3-5天，具体时间取决于个体免疫状态和是否存在并发症。

疱疹性咽峡炎是由肠道病毒感染引起的急性上呼吸道感染，患者会出现发热、咽痛、咽峡部疱疹等症状。该疾病通常表现为急性起病，发热持续3-5天，随后逐渐退热，这是因为肠道病毒感染具有一定的自限性。少数患者，尤其是存在免疫缺陷或合并症的患者，发热持续时间可能会延长，可能需要7-10天才能退热。

在治疗过程中，患者应注意休息，避免剧烈运动，以促进机体恢复，同时，需密切观察病情变化，若发热持续不退或出现其他严重症状，应及时就医。