临床上引起儿子小便时屁股里刺痛的原因较多，常见有肛周脓肿、痔疮、肛裂、尿道炎、尿道息肉等。需要根据具体临床表现和相关检查，进行针对性治疗。

1、肛周脓肿：多由于肛门周围组织感染引起，可导致肛门疼痛、排便不畅，以及小便时尿道刺痛的症状。明确诊断后，需要行肛周脓肿切开引流术，以减轻疼痛症状;

2、痔疮：由于肛门周围静脉曲张，或者肛垫下移引起，排便时腹压增大，可导致痔疮脱出，并伴有排尿不畅、小便时尿道刺痛等症状。可以遵医嘱使用马应龙麝香痔疮膏、痔疮栓等药物治疗;

3、肛裂：长期便秘或者大便过于干燥，可以导致肛管皮肤损伤，引起肛裂，会出现小便疼痛、出血等症状，严重时可以出现小便时屁股里刺痛。可以在医生指导下使用高锰酸钾溶液清洗，必要时行肛门皮瓣技术、肛门内括约肌切断术治疗;

4、尿道炎：一般是淋球菌或非淋球菌引起的尿道炎症，常表现为尿道刺痒、小便疼痛、尿道分泌物增多等症状。可以遵医嘱使用阿奇霉素、红霉素等药物治疗;

5、尿道息肉：一般与炎症刺激、遗传等因素有关，临床可表现为排尿不畅、尿道口滴血、小便疼痛等症状，并且息肉较大时，可刺激局部黏膜，出现屁股里刺痛的症状。可以遵医嘱使用左氧氟沙星等药物治疗，若息肉较大可以采用手术切除。

除上述疾病外，还有尿道肿瘤等疾病的可能性，如果出现症状需要及时就医，明确病因后进行针对性治疗。