发热肌肉酸疼可能是由感染性休克、败血症、急性胆管炎、急性肾盂肾炎、流行性感冒等疾病引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.感染性休克

感染性休克是由于病原体及其毒素进入血液循环系统，导致机体免疫反应异常和炎症介质释放增加，引起组织器官损伤和功能障碍。感染性休克患者可遵医嘱使用抗生素进行抗感染治疗，如头孢曲松钠、亚胺培南西司他丁钠等。

2.败血症

败血症是由致病菌侵入血液并大量繁殖而引起的全身性感染，当致病菌产生的毒素作用于神经细胞时，就会出现发热、肌肉酸痛等症状。患者可在医生指导下通过静脉注射的方式给予抗生素治疗，例如青霉素G、阿莫西林克拉维酸钾等药物。

3.急性胆管炎

急性胆管炎通常由胆道梗阻和细菌感染引起，炎症因子刺激局部组织，进而诱发发热、肌肉酸痛的症状发生。对于急性胆管炎患者，可以考虑在医生指导下采用经皮肝穿刺胆管引流术等方式来缓解不适症状。

4.急性肾盂肾炎

急性肾盂肾炎多由上行感染引起，尿路中存在细菌滋生，产生毒素刺激肾脏黏膜，从而引起发热、腰痛以及乏力等症状。患者需要及时就医，在医生指导下服用盐酸左氧氟沙星胶囊、诺氟沙星胶囊等药物进行治疗。

5.流行性感冒

流行性感冒主要是由流感病毒感染所致，病毒在体内复制的过程中会导致体温调节中枢紊乱，使体温调定点上升，从而引起发热的现象。同时还会伴随代谢增快的情况，此时乳酸堆积会引起肌肉酸痛。针对流行性感冒，患者可以在医生指导下口服磷酸奥司他韦颗粒、扎那米韦吸入粉雾剂等抗病毒药物进行治疗。

针对以上提及的病因，建议患者定期监测体温变化，必要时进行血常规、尿常规、CRP值检测等以评估病情进展。患者应注意休息，保证充足睡眠，避免过度劳累，以促进身体恢复。