扁平疣通常由特定类型的HPV感染引起，因此在感染者体内存在相应的抗原或DNA片段。通过检测这些标志物，可提高诊断准确性；然而，某些情况下，扁平疣的症状可能与其它疾病如脂溢性角化病等相似，单纯依靠HPV检测可能存在误诊风险。为确保正确诊断，应结合临床表现及其它相关检查结果进行综合评估。
除了HPV检测外，医生还可能会推荐进行组织病理学检查、醋酸白试验或生物组织活检来确认诊断。
在考虑扁平疣时，应注意避免搔抓患处以防传播，并且注意个人卫生。若患者出现疑似扁平疣的症状，应及时就医以便获得准确的诊断和适当的治疗。
