做了肛瘘手术肛门流脓可能是由于术后伤口感染或愈合不良导致的。

肛瘘手术后，如果术后护理不当或者存在术后感染，可能会引起肛门周围皮肤及软组织发生炎症反应，进而出现渗出液和脓液。患者可能出现肛门瘙痒、红肿、疼痛等症状，严重时甚至会出现发热、乏力等全身症状。建议患者及时复诊，以便进行进一步检查和治疗。

如果患者在术后未按时服用抗生素以预防感染，则可能导致细菌滋生，引发继发性感染，从而诱发上述现象。此外，若患者术前患有糖尿病且血糖控制不佳，会导致伤口愈合减缓，增加感染风险。

因此，在肛瘘手术后应特别注意伤口的清洁与消毒，避免局部污染和摩擦刺激，同时还要定期复查，监测病情变化，以免延误病情。