鼻窦囊肿手术一般会使用局部麻醉或全身麻醉，因此不会感到疼痛。

局部麻醉是在手术部位注射药物以暂时阻断神经传导，使该区域感觉麻木，从而达到止痛的目的；全身麻醉是通过静脉注射或吸入药物使整个身体进入无意识状态，这也包括了疼痛感知的丧失。由于这两种方式都提供了有效的疼痛控制，所以在进行鼻窦囊肿手术时患者不会感受到明显的疼痛。

如果患者在术后出现剧烈头痛、视力模糊等症状，则可能是出现了严重的并发症，应立即就医处理。

在接受鼻窦囊肿手术前，建议咨询专业医生，了解详细的治疗方案以及可能出现的风险与并发症，并做好充分的心理准备。