先天性巨结肠不能治疗。

先天性巨结肠是胚胎期肠神经发育异常所致，这种疾病通常伴随终身，因此无法治疗。

尽管通过手术切除病变肠段后，患者可能恢复正常生活，但神经细胞损伤造成的消化吸收障碍、慢性炎症等病理变化将持续存在。

新生儿至婴儿期可尝试使用肠道微生物群调节剂改善症状，如双歧杆菌三联活菌胶囊、枯草杆菌二联活菌颗粒等益生菌制剂。这些药物有助于恢复肠道微生态环境，缓解因巨结肠引起的腹泻、腹胀等问题。

先天性巨结肠是一种先天性疾病，早期诊断和治疗至关重要。定期随访患儿的生长发育及排便情况，以及及时处理并发症如营养不良和感染，是确保患儿健康的关键所在。