痛经多是由于内分泌失调、寒凉刺激、精神因素等原因所致，与生理性卵巢囊肿无直接关系。生理性卵巢囊肿通常为功能性囊肿，随着月经周期的变化自行消退，不具有恶变潜能，因此不会对生殖系统产生持续的影响，也不会影响正常的生理活动，所以不会引起痛经。
如果患者在患有生理性卵巢囊肿的同时存在子宫腺肌症或盆腔炎等疾病，则可能会出现痛经的症状。因为这些疾病都可能导致子宫内膜异位或炎症反应加剧，进而引发疼痛。
对于生理性卵巢囊肿，应定期监测其大小变化，以排除恶性可能；对于痛经，建议采取非处方药物缓解症状，避免过度劳累和情绪紧张。若症状持续或加重，应及时就医以便明确诊断并接受适当治疗。
