跑步耳朵疼可能是由外耳道炎、外耳道湿疹、外耳道耵聍栓塞、急性化脓性中耳炎、慢性化脓性中耳炎等疾病引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.外耳道炎

外耳道炎是由病原体侵入外耳道引起的炎症，会导致局部充血、水肿和疼痛。这种炎症状态使得外耳道对刺激更加敏感，从而引起跑步时耳朵疼痛。

患者可在医生指导下使用抗生素药膏进行治疗，如红霉素软膏、克林霉素磷酸酯凝胶等。

2.外耳道湿疹

外耳道湿疹是皮肤接触过敏原后出现的一种变态反应，当过敏原刺激外耳道黏膜时会引起瘙痒感，若频繁搔抓导致破溃则会出现疼痛的情况。此外，剧烈运动时血液循环加快，毛细血管扩张，也会加剧疼痛感。患者可遵医嘱使用抗组胺药物缓解不适症状，如盐酸苯海拉明片、氯雷他定片等。

3.外耳道耵聍栓塞

外耳道耵聍栓塞是指外耳道内分泌物积聚形成硬块堵塞耳道，导致耳闷、听力下降等症状，在跑步时由于头部运动加剧，耵聍刺激外耳道壁，进而诱发疼痛。对于较小的耵聍栓塞，可通过滴入油性物质如橄榄油使耵聍变软易于取出；对于较大的耵聍栓塞，则需由专业医生用镊子或软化剂处理。

4.急性化脓性中耳炎

急性化脓性中耳炎通常由细菌感染引起，炎症因子刺激鼓室粘膜，导致耳痛、耳鸣、听力减退等症状。在跑步过程中，随着体温升高和血液循环加速，炎症扩散，进一步加重耳部不适。患者可以按医嘱服用阿莫西林胶囊、头孢氨苄胶囊等药物控制感染。

5.慢性化脓性中耳炎

慢性化脓性中耳炎多为急性中耳炎未及时治疗或反复发作所致，病变长期存在可能导致鼓室积液或胆脂瘤形成，此时如果受到物理因素影响，比如跑步时震动可能会诱发疼痛。患者应到医院接受鼓室通气管置入术、鼓室成形术等手术方式改善病情。

建议关注耳部疼痛的变化情况，特别是在跑步或其他剧烈活动后是否加剧。必要时，可进行耳镜检查以评估外耳道和中耳的状况。