结肠镜检查通常会检查肛门和直肠。

结肠镜检查旨在全面了解大肠内部状况，而肛门和直肠位于结肠末端，与结肠内部结构密切相关。因此，为了完整评估肠道健康，医生会通过结肠镜检查直接观察肛门和直肠。

如果患者有痔疮、肛裂等疾病时，则需要在做肠镜前先处理好原发疾病再进行检查，以免加重病情或影响检查结果。

在进行结肠镜检查前，应避免食用含纤维素丰富的食物，以减少肠道内容物，方便视野观察。此外，若有特殊症状或不适，应及时告知医生。