精子畸形率高可能会影响自然怀孕。

正常情况下，精子畸形率在4%以下。当精子畸形率高于此范围时，意味着精子结构不完整或功能障碍，这可能影响精子与卵子成功结合，从而降低自然怀孕的可能性。

除了精子畸形率外，男性生殖系统的健康状况、是否存在生育能力相关的疾病以及双方是否处于排卵期都可能影响自然怀孕的成功率。

建议患者定期进行生育力评估和精液分析，以监测精子形态学变化，并采取适当的治疗措施改善精子质量。