高活性干酵母本身不具有毒性，但在大量摄入时可能导致消化系统不适，因此不宜过量食用。
高活性干酵母中含有丰富的酶类物质，如淀粉酶、糖化酶等，这些酶类物质可以促进食物的分解与吸收，改善肠胃功能。若一次性摄入过多，会导致酶类物质分泌增多，进而引起腹部疼痛、腹泻等症状。此外，由于酵母细胞壁的存在，其属于一种异体蛋白，当机体摄入过多时，可能会诱发免疫应答，导致过敏反应的发生，严重者甚至会出现呼吸困难、皮肤瘙痒等症状。
虽然高活性干酵母本身无毒，但不排除存在部分人群对其可能产生过敏反应，出现皮疹、红肿等现象。
在使用高活性干酵母作为食材或添加剂时，应注意控制摄入量以避免潜在的风险，并确保所选用的产品符合食品安全标准。对于特定人群，特别是儿童和孕妇，应在专业人士指导下谨慎使用。
