耳膜穿孔手术后咚咚响可能是由于鼓室内积液或粘连引起的。

耳膜穿孔导致中耳与外耳道相通，引起鼓室负压，促进液体从鼻咽部流入鼓室，从而形成积液。积液在鼓室内移动时可能会发出咚咚声，这是由于鼓室内部结构改变所致。建议患者尽快就医，以便进行进一步检查和治疗，如使用抗生素预防感染或通过鼓室通气管置入术改善症状。

如果患者还伴有耳痛、听力下降等症状，则可能需要再次手术修复耳膜。

术后应避免接触水，保持耳道干燥清洁，以免影响伤口愈合和恢复。同时注意休息，避免剧烈运动，以减少耳内压力变化的影响。