肛门疼痛伴血栓形成可能由内痔破裂、肛裂、血栓性外痔、肛周脓肿或直肠息肉引起，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，以便获得准确诊断和适当治疗。
1.内痔破裂
内痔位于齿状线以上，由于局部静脉曲张或者肛垫下移而形成。
当其发生破裂时会引起出血和肛门疼痛。对于内痔破裂引起的肛门疼痛伴有血栓形成，可以考虑使用马应龙麝香痔疮膏进行治疗，此药具有清热解毒、消肿止痛的功效。
2.肛裂
肛裂是齿状线下缘肛管皮肤层裂开后形成的慢性溃疡，常由便秘引起。排便时干硬粪便刺激受损黏膜会导致剧烈疼痛。患者可遵医嘱使用红霉素软膏等药物缓解不适症状，但需注意用药需谨慎，不可自行盲目用药。
3.血栓性外痔
血栓性外痔主要是因为大便干燥坚硬，在用力排便时导致肛周皮下血管破裂，血液淤积于皮下形成血栓所导致的。血栓对周围组织产生压迫，从而出现肛门疼痛的症状。血栓性外痔可通过手术切除的方式进行治疗，如血栓剥离术、传统外剥内扎术等。
4.肛周脓肿
肛周脓肿通常是由肛腺感染后形成肛周脓肿，炎症向肛门周围扩散，导致肛门周围红肿、疼痛等症状。针对肛周脓肿，需要及时切开引流以促进脓液排出，必要时还需行治疗术。
5.直肠息肉
直肠息肉是指从肠道黏膜表面突出到肠腔内的隆起性病变，可能由遗传因素、生活习惯不当等原因所致。若息肉较大或位置特殊，在排便时易受到摩擦、挤压，进而诱发疼痛。对于较大的结肠息肉，可以在医生指导下通过内镜下息肉电切除术等方式进行处理。
建议患者定期进行肛门指诊、肛门镜检等检查，以便早期发现并处理相关问题。日常生活中还要保持良好的排便习惯，避免久坐、久站，以免加重不适症状。
