男性腹部两侧疼痛可以考虑腹痛、腹部超声检查、胃镜检查、尿常规、腹部CT检查等方法进行诊断和治疗。如果疼痛持续或加剧，应尽快就医以确定具体原因并接受适当治疗。

1.腹痛

腹痛时可以使用阿托品、山莨菪碱等抗胆碱能药物缓解平滑肌痉挛。上述药物适用于胃肠绞痛、肾绞痛等情况。但需注意个体差异及可能引起的副作用。

2.腹部超声检查

腹部超声检查利用高频声波成像技术评估内脏结构异常情况，如肝、胆、胰腺疾病。此方法常用于诊断脂肪肝、胆囊炎等疾病。检查前须空腹至少8小时以确保准确性。

3.胃镜检查

胃镜检查通过将一根带有摄像头的细长管子插入口腔进入消化道，可直接观察食道、胃和十二指肠内部状况。对于上腹部不适、吞咽困难等症状疑似由消化道病变引起时有重要意义。通常在门诊完成，需要预约。

4.尿常规

尿常规包括白细胞计数、蛋白质含量等指标检测，可辅助判断泌尿系统是否感染或损伤。适合排尿后出现尿频、尿急、腰痛等不适症状时使用。取样应在医院急诊室或指定地点按指示进行。

5.腹部CT检查

腹部CT检查采用X射线扫描患者腹部区域，并经过计算机处理形成横断面图像，显示软组织密度变化。CT检查广泛应用于多种腹部疾病的诊断，例如肾结石、结肠梗阻等。检查前需去除金属物品且告知医生过敏史。

在排除阑尾炎的情况下，针对男性腹部两侧疼痛的情况，应考虑肝脏、肾脏或其他内脏器官的问题。建议及时就医，在专业医师指导下完善相关检查，以便明确诊断并获得适当治疗。