喝柠檬水后小便刺痛可能是由于柠檬水中的柠檬酸导致尿液酸化引起泌尿系统刺激所致。

因为柠檬水中含有柠檬酸，该物质可以使得尿液呈现酸性的环境，从而引起尿路刺激，导致排尿时出现刺痛的感觉。这种症状通常比较轻微，但如果持续存在或伴有其他症状，则需要及时就医进行进一步检查以排除其他潜在疾病的可能性。

如果患者还伴随尿频、尿急等症状，则可能与患有膀胱炎有关。因为柠檬水具有一定的酸性，会增加细菌滋生的风险，进而诱发膀胱炎的发生。

在饮用柠檬水时需注意适量，并避免过量摄入，特别是对于有泌尿系结石病史的人群。日常生活中还要多喝水，促进身体新陈代谢，有利于身体健康。