结石小便时菊花刺痛可能是由尿道结石、输尿管结石、膀胱结石、前列腺增生、尿路感染等引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.尿道结石

由于结石移动刺激尿道黏膜引起局部损伤和炎症反应，导致排尿时出现疼痛感。可通过体外冲击波碎石术进行治疗，利用高能级冲击波将大块结石粉碎成较小颗粒以便排出。

2.输尿管结石

输尿管内有结石存在，当结石移动时会对输尿管壁产生摩擦、压迫等刺激作用，进而诱发疼痛。还可能伴随血尿、恶心呕吐等症状。可遵医嘱使用止痛药物缓解不适症状，如阿司匹林、布洛芬等非甾体抗炎药。

3.膀胱结石

膀胱结石会导致膀胱壁受到刺激，从而引起疼痛。此外，还可能会引起尿频、尿急、尿痛等症状。对于较小的膀胱结石，可以通过增加饮水量促进其自然排出；若结石较大，则需考虑手术治疗，例如经尿道膀胱镜下碎石取石术。

4.前列腺增生

前列腺增生患者由于前列腺体积增大，可能会对尿道造成压迫，导致排尿不畅，容易形成尿潴留，久而久之就有可能形成尿道结石。典型表现为尿频、尿急、夜尿增多以及排尿困难。如果确诊为良性前列腺增生，医生可能会建议采用α受体阻滞剂改善排尿功能，如坦索罗辛、特拉唑嗪等。

5.尿路感染

尿路感染会引起尿道黏膜充血水肿，易发生破损，导致排尿时出现疼痛的症状。同时还会伴有尿频、尿急、尿不尽等症状。针对尿路感染，通常可以口服抗生素进行治疗，比如头孢克肟、左氧氟沙星等广谱抗菌药物。

日常生活中应保持充足的水分摄入以促进结石排出，避免辛辣食物如辣椒、生姜等可能加重症状的影响。建议进行泌尿系统超声检查以评估结石大小及位置，必要时还需做尿常规、尿培养等进一步明确诊断。