排尿时肛门疼痛可能是由尿路感染、痔疮或肛裂引起的。

尿路感染是由细菌侵入泌尿系统引起的炎症反应，会导致尿道口红肿、充血，当尿液经过时会引起疼痛；痔疮是直肠静脉曲张所致，排便时会加重肛门周围血管的压力，进而加剧疼痛；肛裂则是由于肛管皮肤破裂形成的创口，排便时粪便摩擦可诱发剧烈疼痛。针对上述症状，应尽快就医以便获得适当的诊断和治疗。

如果患者存在长期便秘病史，则可能因为大便干燥坚硬，在排出过程中划伤肛门黏膜引起轻微损伤，导致在排尿时出现刺痛感。

日常生活中要注意个人卫生，勤换内裤，避免久坐，以免压迫到局部皮肤组织。同时还要多喝水促进新陈代谢，有利于缓解不适症状。