月经来时腰疼的厉害可能是内分泌失调、子宫内膜异位症、盆腔炎、腰椎间盘突出症、腰肌劳损等疾病引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，以便获得适当的治疗。

1.内分泌失调

内分泌失调可能导致体内激素水平失衡，引起生殖系统功能紊乱，进而导致痛经和腰痛。可通过调节生活习惯、饮食习惯以及适当运动进行缓解，如规律作息、均衡饮食等。

2.子宫内膜异位症

子宫内膜异位症是指子宫内膜组织生长在子宫外的情况。当这些组织侵犯到盆腔内的器官和组织时，会引起疼痛，包括月经期间的腰痛。患者可在医生指导下使用非甾体抗炎药进行止痛治疗，如布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等。

3.盆腔炎

盆腔炎是由细菌感染引起的女性上生殖道感染性疾病，炎症刺激会导致腰部出现持续性疼痛，在月经期更为明显。抗生素是主要治疗方法，常用药物有头孢曲松钠、多西环素等。

4.腰椎间盘突出症

腰椎间盘突出症通常由于椎间盘退变或损伤导致髓核突出压迫神经根，此时可伴随下肢放射性麻木、刺痛等症状，少数人会出现腰痛的症状。对于急性发作期的患者，建议卧床休息，配合服用双氯芬酸钠肠溶缓释胶囊、塞来昔布胶囊等药物缓解不适症状。

5.腰肌劳损

腰肌劳损是因为长时间保持一个姿势或者过度劳累导致腰部肌肉疲劳，从而引发疼痛。针对这种情况可以采取热敷的方式促进血液循环，也可以遵医嘱使用麝香壮骨膏、活血止痛膏等药物进行治疗。

月经期间腰疼严重时，应避免剧烈运动，以减少腰部负担。建议进行妇科超声波检查、内分泌检查和腰部MRI扫描，以评估子宫内膜异位症和腰椎间盘突出症等情况。