空腹喝咖啡大便发黑可能是由慢性肾功能不全、上消化道出血等疾病因素导致的，需要针对具体病因进行治疗。

慢性肾功能不全患者肾脏排泄废物的能力下降，无法有效代谢咖啡中的某些成分，导致这些物质积累在体内，进而影响到大便的颜色。上消化道出血时，咖啡因可能会刺激受损的胃黏膜，加重出血症状，从而引发上述情况发生。对于慢性肾功能不全，需要控制蛋白质摄入，减少肾脏负担；而上消化道出血则需及时就医，在医生指导下使用奥美拉唑镁肠溶片、雷贝拉唑钠肠溶片等药物抑制胃酸分泌，保护胃黏膜。

如果患者存在胃炎或胃溃疡等胃部疾病，此时空腹饮用咖啡可能加剧胃部不适症状，导致出现恶心、呕吐等症状。此外，长期大量摄入咖啡因还可能导致依赖性增加，突然停饮会引起头痛、疲劳等戒断症状。

日常生活中应注意合理膳食，避免暴饮暴食以及过度节食等不良饮食习惯，以免引起胃肠功能紊乱，还要保持规律作息，适当运动，有利于身体健康。