巧克力囊肿可能会影响怀孕。

巧克力囊肿是由子宫内膜细胞种植在卵巢上形成的囊状结构，常伴有周期性出血，导致腹痛、月经不规律等症状。该疾病会导致盆腔炎性粘连，进而引起输卵管阻塞，使精子与卵子难以相遇受精，从而影响怀孕。此外，囊肿还可能压迫邻近器官，引发疼痛及不适感，进一步干扰生殖过程。因此，对于计划怀孕的女性来说，如果确诊患有巧克力囊肿，应积极治疗，待病情稳定后再考虑备孕。

若巧克力囊肿体积较小且无症状或症状轻微，则通常不会显著影响怀孕。但具体情况需因人而异，建议咨询专业医生以制定个性化方案。

针对巧克力囊肿，建议定期进行妇科检查以及超声波监测，及时发现并处理任何变化，以减少对生育能力的影响。