女性尿道口旁边长了几个小疙瘩很疼可以考虑药物治疗、激光疗法、冷冻治疗、微波治疗、电灼术等方法进行治疗。如果疙瘩伴有感染或疼痛加剧，应尽快就医以避免病情恶化。

1.药物治疗

外用药膏如氟轻松软膏、氢化可的松等可以减轻炎症反应和疼痛。适用于轻度至中度的皮肤不适。

使用前需评估个体过敏史，并遵循医嘱执行。

2.激光疗法

利用特定波长的激光直接作用于病变组织，具有凝固止血、促进伤口愈合的作用机制。主要用于表浅性皮损及良性增生情况。治疗前后需注意局部保湿，并按医嘱调整饮食。

3.冷冻治疗

通过低温使异常细胞迅速冻结、坏死，达到去除病灶的目的。主要针对小型、良性的表皮层疾病。治疗后应密切观察有无感染迹象，并保持患处清洁干燥。

4.微波治疗

微波能量被病变组织吸收产生高温效应，从而达到消融目标区域的效果。对于某些表浅且体积较小的良性肿块较为适宜。术后要预防感染，并定期复查。

5.电灼术

利用高频电流产生的高温将异常组织快速破坏，达到去除疣体的目的。适合处理数量较少且较深的尖锐湿疣。术后需要严格遵守医嘱做好护理工作。

在诊断明确为尖锐湿疣的情况下，患者应避免搔抓患处以防感染扩散。同时，建议采取安全措施以减少性传播风险，如正确使用避孕套。