做完肛瘘手术后尿道痛，有可能是正常的术后反应，也有可能是尿路感染、尿道损伤、排便困难、心理因素导致。建议前往医院就诊，明确具体原因，进行相应的治疗。

1、术后反应：做完肛瘘手术后，在切口完全愈合之前，会有创面的存在，会导致患者出现局部疼痛的症状，部分患者可能感觉尿道疼痛。此为正常的术后反应，无需特殊处理，随着时间的延长，创面会逐渐愈合，疼痛症状会逐渐消失;

2、尿路感染：做完肛瘘手术后，如果没有加强抗炎治疗，患者抵抗力下降，就有可能导致尿路感染。此时除了尿道疼痛外，还会表现为尿频、尿急、尿痛等症状。患者可遵医嘱口服头孢呋辛酯片、左氧氟沙星片等药物控制感染。同时应多饮水、多排尿，促进炎症消退;

3、尿道损伤：如果在手术过程中操作不当，会导致尿道损伤。做完肛瘘手术后，损伤的尿道有可能出现疼痛症状。此时可以口服布洛芬缓释胶囊、塞来昔布胶囊等药物对症治疗，以缓解疼痛症状;

4、排便困难：由于肛门的位置受到了损伤，所以患者在排便时，会出现比较明显的疼痛症状。如果患者因为疼痛而不敢排便，就会导致大便在肠道内堆积并且变得干燥，从而引起排便困难。此时需要进行导泻治疗，或者使用开塞露顺畅排便，以减轻排便时的疼痛症状;

5、心理因素：部分患者因为对肛门的神经比较敏感，所以在做完肛瘘手术后，会因为心理作用而出现排便疼痛。建议患者多放松心情，避免过于焦虑，必要时可以进行心理疏导。