睡醒后左侧肩胛骨疼可能是睡眠姿势不当、枕头过高、肩周炎、颈椎病、肺栓塞等引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.睡眠姿势不当

睡眠姿势不当可能导致肌肉过度拉伸或压迫神经，引起局部血液循环不畅和缺氧，从而导致疼痛。

调整睡眠姿势通常可以缓解疼痛。例如，使用更合适的枕头来支撑颈部和头部，避免长时间保持同一姿势。

2.枕头过高

枕头过高会使颈部处于过度前屈位，增加颈项部肌肉张力，久而久之会导致肌肉劳损、痉挛甚至肌纤维变性，进而出现疼痛的症状。患者可通过更换低枕高度的枕头进行改善，也可以适当热敷促进血液循环。

3.肩周炎

肩周炎是一种慢性炎症性疾病，主要累及肩关节周围软组织，包括肩袖、滑囊、关节囊等结构，炎症反应可导致肩关节周围疼痛和功能障碍。药物治疗是常见的治疗方法，如遵医嘱口服非甾体抗炎药如布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠肠溶片等止痛消炎；也可通过针灸、推拿等方式减轻不适感。

4.颈椎病

颈椎病是由颈椎退行性病变引起的疾病，当突出的椎间盘或增生的骨刺刺激或压迫邻近的脊髓、神经根时，可能会引起肩背部放射性疼痛的情况发生。针对此类病症，患者可在医生指导下服用营养神经类药物进行调理，比如甲钴胺分散片、维生素B12片等。

5.肺栓塞

肺栓塞是指血流中固体物质阻塞肺动脉主干或分支，由于栓子堵塞肺血管会引起胸痛、呼吸困难等症状，如果栓子位于左侧肺部则会出现左肩胛骨处疼痛的现象。对于急性大面积肺栓塞，需要紧急处理，建议立即就医并接受专业医疗团队的评估和管理，以减少死亡风险。

日常生活中应关注睡眠质量，避免不良睡眠姿势，以免加重不适症状。若疼痛持续不缓解或者伴有其他症状，建议及时就医进行X光检查、CT扫描或MRI成像等影像学检查，以便进一步诊断和治疗。