鳃裂瘘管微创手术的风险因个体差异而异，通常取决于患者的年龄、基础健康状况以及是否存在合并症。

患者年龄越大，身体各系统的功能储备越低，对创伤的耐受力也较差，因此更容易发生并发症。基础健康状况包括心脏、肺部等器官的功能是否正常，有无高血压、糖尿病等慢性疾病。合并症指除鳃裂瘘管外，患者同时存在的其他疾病，如甲状腺功能亢进症。这些因素都会增加手术的风险。

若患者存在凝血功能异常或局部感染，则可能需要在术前调整后再行手术，以减少术后出血和感染风险。

实施鳃裂瘘管微创手术需谨慎评估风险与收益，并确保由经验丰富的医生团队执行，以降低手术风险。