肛瘘手术后大便发黑可能是术后服用抗炎镇痛药所致。

术后服用抗炎镇痛药可能会抑制胃黏膜的保护作用，导致胃酸分泌增加，进而引起胃黏膜损伤和出血，血液中的红细胞破裂释放出含铁血黄素，与硫化物结合形成黑色素，使大便呈现黑色。这种情况下，患者还可能出现恶心、呕吐、上腹部疼痛等症状。

如果患者在术后出现持续性腹痛或发热现象，则需考虑是否存在术后感染等情况发生。

术后患者应密切观察排便颜色变化，若发现异常应及时告知医生，并完善相关检查以明确原因。日常生活中还要注意保持局部清洁卫生，以免诱发感染。