新生儿肠道感染治好后一般不会留下明显的后遗症。

新生儿肠道感染主要是由各种致病微生物引起的肠道炎症性疾病，若得到及时诊断与规范处理，通常能够有效控制病情发展，防止出现严重的并发症，因此很少会遗留后遗症。少数情况下，如果感染引起了严重的肠道出血、穿孔等并发症，则可能会增加后遗症的风险。

新生儿肠道感染可能引起巨球蛋白血症、脑膜炎等并发症，这些疾病可能导致神经系统受损，影响智力发育，从而导致认知功能障碍等后遗症。

在新生儿肠道感染期间，家长应注意监测孩子的症状变化，并遵循医嘱完成整个疗程以减少后遗症风险。必要时，可咨询儿科医生或营养师，制定合理的喂养计划，确保孩子获得足够的营养支持，促进康复。