长卵巢囊肿不一定能自然怀孕。

虽然大部分良性卵巢囊肿不影响怀孕，但恶性肿瘤、子宫内膜异位症等可能导致输卵管堵塞，进而影响受精卵着床。此外，若囊肿体积较大压迫到盆腔组织结构，则不利于精子与卵子的结合，此时则无法自然怀孕。对于有生育需求的患者，建议在医生指导下通过超声检查评估囊肿性质及大小后再考虑是否进行备孕。

如果卵巢囊肿为功能性囊肿或黄体囊肿，在月经结束后可能会自行消失，不会影响怀孕；而如果是巧克力囊肿，则可能会影响怀孕，因为其会导致盆腔炎症反应，影响输卵管通畅性。

针对卵巢囊肿的治疗方案需个体化制定，应避免盲目使用药物以促进排卵，以免加重病情。同时，保持良好的生活习惯和规律的生活作息也有助于提高生育能力。