甲硝唑对厌氧菌有较好的抗菌作用，因此可以用于治疗厌氧菌为主的疾病如牙周炎。
甲硝唑能有效抑制或杀灭多种厌氧菌，包括革兰氏阳性及阴性厌氧球菌、杆菌等，从而减轻由厌氧菌过度繁殖导致的牙周组织破坏和感染。该药口服后迅速吸收，在体内广泛分布，并可透过血-脑脊液屏障，其代谢产物5-氨基咪唑衍生物具有抗厌氧菌的作用。此外，甲硝唑还可影响DNA代谢，使细菌的RNA和蛋白质合成受到干扰，进而抑制细菌生长和繁殖。
如果患者对甲硝唑过敏，则不能使用甲硝唑片进行治疗，以免引起皮疹、瘙痒等症状。
在使用甲硝唑时需注意观察是否出现药物不良反应，同时应保持良好的口腔卫生习惯，定期清洁牙齿，以利于疾病的恢复。
