眼皮上长丝状疣可以考虑使用氟尿嘧啶、维A酸、水杨酸、曲安奈德等药膏进行治疗。但是眼部疾病需要谨慎处理，建议患者在专业医生指导下使用药物，并密切观察疣体变化。

1.氟尿嘧啶

氟尿嘧啶适用于皮肤表面出现异常增生的情况。该药物能够抑制DNA合成和细胞分裂，对多种皮肤癌有较好的效果。使用时需注意剂量控制及可能出现的血液学毒性。

2.维A酸

维A酸对于由角化过度引起的丝状疣可能有效。此药物具有调节表皮细胞分化的作用，可改善角质层代谢异常。遵循医嘱进行外用，监测潜在的皮肤光敏性反应。

3.水杨酸

水杨酸可用于角化型皮肤病如丝状疣的治疗。其具有角质软化和抗真菌功效，能减少角质层厚度。避免长期大面积使用以防止引起其他皮肤问题；孕妇、哺乳期妇女应谨慎使用。

4.曲安奈德

曲安奈德局部注射可用于较大且较顽固的丝状疣。该药物为长效糖皮质激素类药物，具有免疫抑制和抗炎作用。须在专业医生指导下进行注射，并注意观察注射部位是否有感染等不良反应发生。

患者平时要保持患处清洁干燥，避免搔抓以防继发感染。同时还要调整饮食结构，尽量不要吃辛辣刺激性的食物，以免影响病情恢复。