肛门长痘痘且伴有疼痛可以考虑中药外敷、坐浴、镇痛药物、抗病毒药物、抗生素治疗等方法来缓解症状。如果症状持续不缓解或加重，建议及时就医以获得专业治疗。

1.中药外敷

使用具有清热解毒、消肿止痛功效的中草药如金银花、蒲公英等煎煮后外敷于患处，可以缓解局部炎症。适用于轻度至中度疼痛且伴有红肿热痛症状的患者。

2.坐浴

采用温盐水或者高锰酸钾溶液进行局部清洁及消毒处理，并促进伤口愈合。此方法适合改善痔疮引起的不适症状，但需注意水温适宜以免造成二次损伤。

3.镇痛药物

通过口服或注射非甾体类抗炎药如布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等来减轻疼痛。对于无法忍受剧烈肛周疼痛者有较好的效果。长期服用需监测肝肾功能。

4.抗病毒药物

针对病毒感染所致的肛门疾病可选用抗病毒药物如阿昔洛韦片、更昔洛韦胶囊等进行治疗。主要用于由疱疹病毒感染引起的相关疾病，在医生指导下合理用药。

5.抗生素治疗

如果考虑细菌感染导致的肛门疾病，则需要在医师指导下使用相应敏感性高的抗生素进行治疗，例如头孢克肟分散片、罗红霉素分散片等。主要针对存在化脓性病变或疑似细菌感染时使用。

在处理肛门疼痛与异常皮肤状况时，应避免自行挤压或搔抓受累区域以减少继发感染风险。同时保持肛周卫生，穿着宽松透气的内裤也有助于病情恢复。