儿童病毒性结膜炎可以遵医嘱使用利巴韦林、更昔洛韦、阿昔洛韦或干扰素等药物进行治疗。由于儿童的特殊体质，如果症状持续或加重，应尽快就医以获得适当的治疗。

1.利巴韦林

利巴韦林适用于治疗由呼吸道合胞病毒、流感病毒和风疹病毒感染的儿童患者。该药物具有广谱抗病毒的作用。肾功能损害者应谨慎使用本品。

2.更昔洛韦

更昔洛韦可用于治疗患有巨球蛋白血症的儿童患者的免疫抑制期的预防感染。此药物能选择性地与人类疱疹病毒-5DNA多聚酶复合物，从而抑制病毒DNA合成。接受静脉注射更昔洛韦治疗的病人须密切观察可能发生的血液学参数异常。

3.阿昔洛韦

阿昔洛韦用于治疗单纯疱疹病毒感染引起的儿童病毒性结膜炎。其能够抑制病毒复制。肾功能不全患者需调整剂量。

4.干扰素

干扰素可以改善由多种病毒感染引起的儿童结膜炎的症状。该药物通过刺激机体产生抗病毒蛋白，来阻止病毒繁殖。使用时应注意可能出现的副作用，如发热、头痛等。

此外，在治疗儿童病毒性结膜炎期间，家长还要注意患儿眼部卫生，避免接触过敏原及诱发因素，以免加重病情。