甲状腺功能亢进症合并肝功能不全时，可以考虑甲亢控制、肝脏保护、肝功能指标监测、营养支持治疗等措施进行治疗。

1.甲亢控制

通过抗甲状腺药物如甲巯咪唑、丙硫氧嘧啶等来抑制甲状腺激素合成，减轻症状。适用于控制甲状腺功能亢进引起的肝功能异常。

2.肝脏保护

使用保肝药物如水飞蓟宾、甘草酸制剂等以改善肝细胞功能。针对甲亢导致的肝损伤提供辅助性保护作用。

3.肝功能指标监测

定期检测肝功能相关指标如ALT、AST、ALP水平变化情况。用于评估甲亢对肝脏的影响及治疗效果跟踪。

4.营养支持治疗

保证充足均衡饮食，补充必要的维生素和矿物质，并根据医嘱调整蛋白质摄入量。在甲亢管理中起到维持机体正常代谢和修复受损组织的作用。

患者应遵循医嘱，合理用药，避免滥用可能导致肝毒性的药物。同时，保持良好的生活习惯，如戒烟限酒，有助于减轻甲亢对肝脏的损害。