慢性睾丸炎伴双侧睾丸萎缩可能需要遵医嘱使用泼尼松、阿奇霉素、头孢曲松、环丙沙星、多西环素等药物治疗。由于涉及男性生育能力，建议及时就医以获得专业治疗。

1.泼尼松

泼尼松适用于治疗自身免疫性疾病、过敏反应等引起的睾丸炎伴随的睾丸萎缩。该药物具有抗炎和抑制免疫应答的作用。长期使用时需监测血糖、血压变化及电解质水平。

2.阿奇霉素

阿奇霉素可用于细菌感染所致的慢性睾丸炎。其通过干扰细菌蛋白质合成来起到抗菌效果。服用此药期间不宜驾驶机动车辆或操作精密仪器。

3.头孢曲松

头孢曲松可作为敏感菌株所致慢性附睾炎伴发双侧睾丸萎缩的优选抗生素。本品能有效杀灭多种革兰氏阴性菌。应用本品患者以出现直接抗球蛋白试验阳性反应和发生溶血性贫血。

4.环丙沙星

环丙沙星对于耐药菌株导致的慢性附睾-睾丸炎有治疗价值。本品为广谱杀菌剂，对多数细菌有较强的杀灭作用。肾功能减退者需慎用。

5.多西环素

多西环素可以治疗由特定病原体感染引起的慢性附睾-睾丸炎。本品可透过细菌细胞膜，在细菌内浓度较高，因此具有较好的抗菌作用。口服吸收较完全，食物不影响其吸收。

针对慢性睾丸炎合并双侧睾丸萎缩的情况，患者应在医生指导下进行治疗，同时注意休息，避免过度劳累，保持良好的生活习惯，以促进病情恢复。