肛门指检后特别疼痛可能与肛门括约肌损伤有关。

肛门指检是通过医生的手指进入患者的肛门进行检查的一种方法，此时需要使用手指对肛门周围组织进行按摩、触诊等操作，因此会导致局部肌肉受到刺激而产生疼痛感。这种疼痛一般会在短时间内自行缓解，但如果持续时间过长或者疼痛程度过于剧烈，可能意味着存在肛门括约肌损伤或其他相关疾病。

如果患者在进行肛门指检时感到特别疼痛，还伴有出血或肿胀等症状，则可能是由于痔疮、肛裂等问题引起的。这些疾病可能导致肛门黏膜破损或炎症反应加剧，从而导致疼痛感增加。

总之，在进行肛门指检后，应避免立即坐立以减少肛门压力，并观察是否有异常表现。若疼痛持续不缓解或伴随其他症状，应及时就医进一步评估。